Radi efikasnijeg izvršavanja zadataka i uključivanja što šireg kruga aktivista u aktivnosti koje organizuje i vodi, Glavni odbor UGS “Nezavisnost”formirao je programske odbore.
Članovi/ce programskih odbora su članovi/ce Glavnog odbora i aktivisti/kinje sindikata u preduzećima – ustanovama, sa sindikalnim iskustvom i stručnim znanjem iz oblasti kojom se programski odbor bavi, kao i eksperti za pojedine oblasti.
Zadatak programskih odbora je da celovito i sistematski prate i analiziraju određena pitanja i da predlažu stavove i pokreću inicijative pred Glavnim odborom UGS.

Glavni odbor UGS “Nezavisnost” do sada je formirao programske odbore za sledeće oblasti:

- zakonodavno-pravnu i radno-pravnu zaštitu, Predsednica  Ružica Radulović;
- ekonomski razvoj, socijalnu politiku i privatizaciju, Predsednik Dragan Vesić;
- bezbednost i zdravlje na radu, Predsednik Slavoljub Luković;
- kolektivno pregovaranje;
- saradnju sa političkim strankama, sindikatima, NVO, Predsednik Zoran Stojiljković;
- međunarodna sindikalna saradnja, Predsednik Jaćim Milunović;
- organizaciju, razvoj i širenje mreže;
- informisanje, Predsednik Dragan Milanović-Pilac.